Dans les abysses, une biodiversité riche et méconnue
Une équipe de chercheurs internationaux (Norvège, Suisse, France, UK, Allemagne, Espagne, USA) notamment du laboratoire Adaptation et diversité en milieu marin (AD2M - CNRS / Sorbonne Université) au sein de la Station Biologique de Roscoff (SBR, CNRS/Sorbonne Université) a produit et analysé un jeu de données de metabarcoding ADN à partir de 1700 échantillons prélevés dans les couches photique, aphotique, et sédimentaires profondes de l’océan à l’échelle planétaire. Les résultats, publiés dans Science Advances, montrent que les abysses abritent une biodiversité largement supérieure à celle du plancton, et en majorité inconnue. Ils dévoilent aussi les relations complexes entre biodiversités planctonique et benthique dans le processus clef de la pompe à carbone océanique.
Le plus grand biome de notre planète est l’océan, qui couvre 71 % de la surface du globe avec une profondeur moyenne de 3800 mètres. C’est un écosystème intégré et continu, aux dimensions spatio-temporelles extrêmes et difficiles d’accès. Il est pourtant nécessaire de le mesurer dans sa globalité pour comprendre son fonctionnement et son rôle dans le système Terre. Il s’agit notamment de connaître la biodiversité globale de l’océan, et de comprendre comment cette biodiversité se structure dans l’espace et le temps, et interagit entre les couches de surface baignées de lumière et les sédiments profonds, froids et obscurs, où la matière organique peut être recyclée par le vivant, ou alors séquestrée pour des millénaires.
Une étude publiée dans Science Advances ouvre la voie à une mesure homogène et globale du vivant océanique. Les chercheurs ont séquencé massivement (metabarcoding eucaryote) l’ADN environnemental extrait de centaines d’échantillons de sédiments profonds récoltés au cours de 15 campagnes océanographiques dans tous les grands bassins océaniques entre 2010 et 2016. Ces séquences ont été intégrées aux données similaires produites par les expéditions circum-globales Tara Oceans et Malaspina sur les couches d’eau photiques et aphotiques (épi/meso/bathy/abysso-pélagiques) de l’Océan. Ce jeu de données complet apporte la première vision intégrale et planétaire de la biodiversité eucaryote dans l’océan global.